• Mecanismos moleculares y celulares de la simbiosis fúngico-bacteriana
• Reproducción y desarrollo fúngico en contextos simbióticos
• Ecología y funciones de las interacciones endosimbióticas entre hongos y bacterias

• Evolución del tamaño del genoma en salamandras neotropicales.

• Microbioma de salamandras neotropicales.

• Diversificación y evolución de anfibios y reptiles de Mesoamérica.

• Genómica funcional del desarrollo reproductivo en plantas.

• Control genético y epigenético de la sexualidad y de la apomixis.

• Inducción de apomixis en gramíneas y leguminosas de interés agrícola.

• Modificaciones tempranas del desarrollo de semillas.

• Origen y domesticación de cultivos mesoamericanos.