- Salud del medio ambiente.
- Biotecnología marina.
- Estudio de los procesos y mecanismos que controlan la selección del hábitat en invertebrados bentónicos marinos: escalas de heterogeneidad, procesos hidrodinámicos, importancia relativa del espacio y del alimento sobre la producción secundaria bentónica.
- Desarrollo de la biotecnología para el cultivo integrado multitrófico de organismos acuáticos en sistemas cerrados con base en peces marinos, pepino y erizo de mar, macroalgas y plantas halófitas.
- Nutrición acuícola.
- Cultivo de tilapia.
- Taxonomía, ciclos de vida y ecología de parásitos de organismos acuáticos silvestres y cultivados.
- Patrones de transmisión de parásitos en series de tiempo de largo plazo.
- Comunidades de bacterias y parásitos como indicadores de estrés ambiental.
- Teledetección satelital.
- Análisis geoespacial.
- Gestión integrada del espacio costero.